noah/tasks/siegen.yml

# https://taskfile.dev

version: '3'

tasks:
  default:
    desc: harvesten und transformieren
    deps: [harvest]
    cmds:
      - ulimit -n 10000 # provisorisch Exit durch "too many open files" vermeiden
      - task: refine
      - task: check
      - task: split
      - task: validate
      - task: zip

  harvest:
    desc: nur harvesten
    dir: data/siegen/harvest
    cmds:
      - METHA_DIR=$PWD metha-sync --format xMetaDissPlus https://dspace.ub.uni-siegen.de/oai/request
      - METHA_DIR=$PWD metha-cat --format xMetaDissPlus https://dspace.ub.uni-siegen.de/oai/request > siegen.xml

  refine:
    dir: data/siegen/refine
    ignore_error: true # provisorisch verwaisten Java-Prozess bei Exit vermeiden https://github.com/go-task/task/issues/141 
    env:
      PORT: 3334
      RAM: 8G
      PROJECT: siegen
    cmds:
      # OpenRefine starten
      - $OPENREFINE -v warn -p $PORT -m $RAM -d $PWD > openrefine.log 2>&1 &
      - timeout 30s bash -c "until curl -s http://localhost:$PORT | cat | grep -q -o OpenRefine ; do sleep 1; done"
      # Import (erfordert absoluten Pfad zur XML-Datei)
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --create "$(readlink -e ../harvest/siegen.xml)" --recordPath Records --recordPath Record --storeEmptyStrings false --trimStrings true --projectName $PROJECT
      # Vorverarbeitung: Identifier in erste Spalte; nicht benötigte Spalten (ohne differenzierende Merkmale) löschen; verbleibende Spalten umbenennen (Pfad entfernen)
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/vorverarbeitung.json $PROJECT
      # URNs extrahieren: Dubletten entfernen und verschiedene URNs zusammenführen
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/urn.json $PROJECT
      # Fehlende Direktlinks aus Format METS ergänzen: Wenn keine Angabe in ddb:transfer, dann zusätzlich METS Format abfragen und daraus METS Flocat extrahieren
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/direktlinks.json $PROJECT
      # Datensätze ohne Direktlink auf ein PDF löschen
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/nur-mit-pdf.json $PROJECT
      # Aufteilung dc:subject in ddc und topic
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/ddc-topic.json $PROJECT
      # Standardisierte Rechteangaben (Canonical Name aus CC Links in dc:rights)
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/cc.json $PROJECT
      # Internet Media Type aus ddb:transfer ableiten: Mapping manuell nach Apache http://svn.apache.org/viewvc/httpd/httpd/trunk/docs/conf/mime.types?view=markup
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/mime.json $PROJECT
      # DOIs aus Format OAI_DC ergänzen: Für alle Datensätze zusätzlich DC Format abfragen und daraus dc:identifier mit Typ doi extrahieren
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/doi.json $PROJECT
      # Anreicherung HT-Nummer via lobid-resources: Bei mehreren URNs ODER-Suche; bei mehreren Treffern wird nur der erste übernommen
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/hbz.json $PROJECT
      # Sortierung mods:nonSort für das erste Element in dc:title
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/nonsort.json $PROJECT
      # DINI Publikationstypen aus dc:type extrahieren
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/dini.json $PROJECT
      # Visual Library doctype aus dc:type: Wenn thesis:level == thesis.habilitation dann doctype oaHabil
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/doctype.json $PROJECT
      # Links auf Volltexte prüfen: HTTP status code ermitteln (z.B. 200)
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/linkcheck.json $PROJECT
      # Datenstruktur für Templating vorbereiten: Pro Zeile ein Datensatz und leere Zeilen löschen
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --apply ../../../rules/siegen/join.json $PROJECT
      # Export in METS:MODS mit Templating
      - |
        $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --export --template "$(< ../../../rules/siegen/template.txt)" --rowSeparator "
        <!-- SPLIT -->
        " --output siegen.txt $PROJECT        
      # Export für Debugging
      - $OPENREFINE_CLIENT -P $PORT --export --output siegen-debug.tsv $PROJECT
      # OpenRefine beenden
      - ps -o start,etime,%mem,%cpu,rss -p $(lsof -t -i:$PORT) # Statistik
      - kill -9 $(lsof -t -i:$PORT) # SIGKILL (-9) verhindert unnötigen Speichervorgang
      - rm -rf ./*.project* && rm -f workspace.json # temporäre Dateien von OpenRefine löschen
    sources:
      - ../harvest/siegen.xml
      - ../../../rules/siegen/*.json
      - ../../../rules/siegen/template.txt
#     - ../../../rules/common/*.json
    generates:
      - siegen.txt
      - siegen-debug.tsv

  check:
    dir: data/siegen/refine
    cmds:
      # Logdatei von OpenRefine auf Warnungen und Fehlermeldungen prüfen
      - if grep -i 'exception\|error' openrefine.log; then echo 1>&2 "log contains warnings!" && exit 1; fi

  split:
    dir: data/siegen/split
    cmds:
      # in Einzeldateien aufteilen
      - csplit -q ../refine/siegen.txt --suppress-matched '/<!-- SPLIT -->/' "{*}"
      # ggf. vorhandene XML-Dateien löschen
      - rm -f *.xml
      # Identifier als Dateinamen
      - for f in xx*; do mv "$f" "$(xmllint --xpath "//*[local-name(.) = 'recordIdentifier']/text()" "$f").xml"; done
    sources:
      - ../refine/siegen.txt
    generates:
      - ./*.xml

  validate:
    dir: data/siegen/
    cmds:
      # Validierung gegen METS Schema
      - wget -q -nc https://www.loc.gov/standards/mets/mets.xsd
      - xmllint --schema mets.xsd --noout split/*.xml > validate.log 2>&1
    sources:
      - split/*.xml
    generates:
      - validate.log

  zip:
    dir: data/siegen/
    cmds:
      # ZIP-Archiv mit Zeitstempel erstellen
      - zip -q -FS -j siegen_{{.DATE}}.zip split/*.xml
    sources:
      - split/*.xml
    generates:
      - siegen_{{.DATE}}.zip      

  delete:
    desc: cache löschen
    cmds:
      - rm -rf data/siegen