seminar-wir-bauen-uns-einen.../scripte/count-tsv.sh

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Bash
Raw Normal View History

#!/bin/bash
# Script zur Zählung von belegten Werten in TSV-Dateien
# Stand: 20.11.2016
# Nutzung: ./count.sh file.tsv
# Abfrage der Dateinamen
if [ -z "$1" ]
then
echo "Bitte Dateinamen angeben!"
echo "Beispiel: ./count.sh file.tsv"
exit
else
echo "Folgende Dateien werden untersucht:"
files=($*)
echo ${files[@]}
echo ""
fi
# Schleife für mehrere Dateien
for file in "${files[@]}"; do
# Spaltennamen erfassen
readarray columns < <(head -q -n1 haw_000001_450200_minimal.tsv | tr '\t' '\n' | cat)
# Belegte Zellen in Spalten zählen und ausgeben
number=1
for column in "${columns[@]}"; do
echo -e ${column} "\t\t" $(cut -d$'\t' -f ${number} ${file} | grep -v '^$' | wc -l)
number=$(($number+1))
done
done